Sehe ich nicht so! Wenn ich die Specs richtig in Erinnerung habe, ist im Gegensatz zu ATX das Motherboardlayout gespiegelt. D.h. das Board sitzt im Gehäuse auf dem linken Seitenteil des Gehäuses anstatt des rechten. Daraus resultiert, daß alle PCI Karten auf dem Kopf herum eingebaut werden, was insbesondere bei Grafikkarten und deren Wärmeabgabe deutliche Vorteile hat, weil die Wärme der GPU direkt nach oben abgeführt werden kann und nicht erst um die Karte herum strömen muß.
Außerdem ist die CPU beim BTX Standard weiter nach unten gerutscht (falls ich es recht im Sinn habe), ansaugende Gehäuselüfter "vorne unten" sollten es so leichter haben die CPU zu kühlen.
Was den Abschied der Legacy Schnittstellen angeht: mir soll's recht sein, die braucht man heute in der Tat nicht mehr (wenn auch aus Kompatibilitätsgründen ein Wegfall kritisch sein könnte, Stichwort: alte non-usb Peripherie).