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Neues THINK und neues Protein !

Bombenleger / 28 Antworten / Flachansicht Nickles

Hi Cruncher

Dieses Posting diente bis 14.12.2001 als Fortschritts-News in Sachen aktueller UD-Updates.

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In naechster Zeit kann es Download-Schwierigkeiten geben:

THINK-Update und die neuen Proteine

- "Fibroblast GF Recept." 1AGW (FGF) (aehnelt Q3 und ist Kinase):

==> 12 Molekuele à 100 Derivate je % = 1200 Molekuele je WU = LRMs

- "Cyclin Dep. Kinase 2" 1AQ1 (CDK2) (Spaghetti-Eis ?):

==> 20 Molekuele à 100 Derivate je % = 2000 Molekuele je WU = MfHs (?).

Depends on how you define LRM.

Some people call a LRM something that runs more than an hour. Some
people call it something that runs more than 5 hours. Others think
something longer than 50 hours LRM...

Expected run time for a WU is 15-20 hours on a PII 400. Will they run
past that? Yes. However timing tests done in beta and alpha wus
averaged ~20 hours or so. But as usual there is no real way to tell if
a WU is a LRM until it is run.

Thanks
moose


Und ich dachte immer die wuerden ihr Comparison Device crunchen lassen.

Happy crunching und nicht sauer sein wenns ab jetzt laenger dauert ...

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Was hat sich eigentlich ausser dem Grafikupdate im THINK geaendert ?

Es ist kaum zu glauben, aber die Eigensicherung, ohne Hilfsmittel,
findet jetzt jeweils nach jedem beendeten Molekuel statt bzw. alle
100 Derivate. Das nenne ich Fortschritt, denn vorher wurde ja nur
jedes volle % gesichert und das wuerde bei 1AGW, 1AQ1 erheblichen
Zeitverlust bedeuten, wenn innerhalb eines % der Agent beendet wuerde.

Jetzt meint Ihr bestimmt, was denn, vorher hatte 1 % nur 1 Molekuel.
Das mag bei RAS, 6COX noch stimmen, aber VEGF und SOD haben 2 je %
und die TKs mindestens 2. Nur bei den neuen faellt es auf das je
Molekuel gesichert wird, waehrend bei den alten fruehestens je %
gesichert wurde. Das liegt aber daran das die Molekuele der alten
um einiges schneller, da weniger umfangreich, berechnet wurden.

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Was hat sich durch diese Updates im Agenten geaendert ?

Absolut nichts. Ich hatte mich schon mehrfach beschwert das die Zeit/Punkte
im Agenten von den Web-Statistiken abweicht und es sollte jetzt behoben
sein. Alles Quatsch. Das einzige was die behoben haben war die Anzeige-
differenz zwischen der Member- und Team-Statistik in den Web-Routinen.
Im Agenten selbst sind zwar minimale Unterschiede, aber was stimmt denn
nun ? Kurz nachdem THINK fertig ist kann man noch die Task-Time im
Agenten sehen, bevor er auf Preparing/Analyzing/Connecting wechselt.
Genau diese Zeit wird zum vorherigen Gesamt im Agenten addiert. Das
bedeutet also der Agent stimmt und die Web-Statistiken "schoenen",
wenn sie ueberhaupt "upgedated" werden (von regelmaessig keine Spur).

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PS: RM hat seine alte Page wieder online.

Damit UD-Mon die Teil richtig erkennt, einfach die UD_Mon.ini editieren
und unter proteins die Zeilen 891437=1AGW und 897782=1AQ1 einfuegen,
wenn das Frontend selbst keine Moeglichkeit zur Anpassung bietet.
Desweiteren sind im entsprechenden Cache alle ud_7xxx.exe, sowie
ud_7xxx.dll ueberfluessig, denn das neue THINK benutzt jetzt ud_895166.exe
und ud_895167.dll, natuerlich nur wenn der Cache bereits "upgedated" ist.



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polytaen Bombenleger „Hi Gregor Klick mal in meiner VK auf den Zugenrausstrecker, dann weisst Du was...“
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Servus,

uiuiiu , imposant (im hintern kies *g*). Ich werd' mal hinne kachen und sehen, was ich beitragen kann. Bin aber gerade daheim (Weihnachten mit family) und daher an nem fremdrechner. Daten kommen bald, der Rechner kann ja auch offline rechnen.

Raf.. ja! WICHTIGES Krebsprotein. Ist in einer Signalkaskade, die das Zellwachstum steuert (Krebs ist ja nichts anderes als unkontrolliert wuchernde Zellen). Wenn das kaputt ist, bekommt die Zelle dauernd das signal sich zu teilen (primitiv ausgedrückt).
Die Signalkaskaden fünktionieren wie ein schneeballprinzip. d.h. auf der Zelle ist ein Rezeptor, der ein Signal bekommt. Dann kommen interne Proteine, die das Siganl immer weiterreichen und dabei verstärken. Raf interagiert mit Ras (habt ihr auch schon gerechnet) usw. Raf ist extrem gefährlich... mehr wenn ihr mich wiederseht. *g*

1AGW (FGF) f? growth factor
1AQ1 (CDK2) Cyclin dependent kinase
1FLT (VEGF) vaso-epidermal growth factor
1IEP (C-ABL) ???
1IR3 (PTK)P? Tyrosin kinase
1ISA (SOD) Superoxiddismutase
6COX (COX-2) Cyclooxygenase 2
821P (RAS) Ras-Raf-Signalkaskade
Q3 (Tyrosine Kinase) irgendeine TK

GFs sind Wachstumsfaktoren, d.h. Rezeptoren auf der Zelle. Wenn hier ein Signal ankommt, wird es über Siganlkaskden (s.o.) IN der Zelle weitergeleitet und verstärkt, dadurch entsteht ein Signal im Kern der Zelle, dass sie sich teilen soll. Man kann verstehen, dass wenn der Rezeptor mutiert, und er dauerhaft ein Signal abgibt, dass sich die Zelle unkontrolliert teilt und Krebs entsteht. Daher die Suche nach inhibitoren.

Rezeptortyrosinkinasen...Wie GFs, nur dass sie über eine andere art Signalkaskaden wirken.

Ras-Raf sind teile solcher Signalkaskaden.

SOD2 ist zur entgiftung von Radikalen (böse chemische Teilchen) im Menschen. Wenn zu viele radikale auftauchen, wird die DNA (ergbut) des Menschen beschädigt, dadurch entstehen Mutationen, die Krebs auslösen können.

Die Nummern am Anfang kann ich nicht zuordnen, müssen tatsächlich interne Nomenklaturen sein.

Bis denne
poly

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