Das mit dem d.ip.de könnte tatsächlich funktionieren, wenn auch recht umständlich. Die IP-Upload-Software für Linux ist ein Perl-Skript, kann also verändert werden. Ihr müsstet alle Domains, die auf eurem Server liegen bei d-ip anmelden. Die Upload-Software müsste dann so modifiziert werden, dass sie eure dynamische IP-Adresse für alle Domains einzeln bei d-ip aktualisiert. Die Liste der Domains sollte dabei aus einer Textdatei oder Datenbank ausgelesen werden, um auf einfache Weise neue Domains hinzufügen zu können. Bei dieser Vorgehensweise sollten dann auch die virtuellen Webserver funktionieren.
Es ist allerdings möglich, dass d-ip verhindert, dass eine IP-Adresse für mehrere Domains angemeldet wird, um genau das zu verhindern, was ihr vorhabt. Im Zweifelsfall helfen nur Nachfragen oder Ausprobieren.