Entweder du löscht die Linux-Partitionen ,wenn du die Partitionierung neu machen willst. Oder du formatierst die Linuxpartitionen mit dem Dateisystem ext3 einfach nochmal neu.
Die Wahl des Desktops ist reine Geschacksache. Man kann auch Gnomeprogramme unter KDE starten oder umgekehrt, ein Programm von KDE unter Gnome starten.
Man kann auch Gnome und KDE installieren und abwechselnd von kdm oder gdm (grafische Anmeldebildschime) starten lassen.
Und wenn dir SUSE nicht zusagt, dann kannst du auch eine andere Distribution nutzen. Beispielsweise wird bei Debian lenny immer noch KDE 3.5.9 genutzt, weil KDE 4 noch gar nicht fehlerfrei läuft.
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