Hallo,
zunächst die Fakten: Der Adaptec 2940 UW leistet max. 40 MB/s; er beherrscht nur den SE-Mode. Allerdings sollten diese 40 MB beim Booten auch angezeigt werden (Sync= 40).
Jetzt die Ratschläge: Du hast die Platten mit einem SE-Kabel angeschlossen, das am Ende aktiv terminiert ist. Installiere statt des LVD-Terminators einen aktiven SE-Terminator(!); manche LVD-Terminatoren sperren sich gegen die anderen Spannungs-Verhältnisse am SE-Strang! Setze an der letzten Platte im Kabel (und nur hier!) zusätzlich den Jumper für "Termination Power", denn "Terminierung" und "Termination Power" sind keine identischen Begriffe! Ich gehe davon aus, daß Du die Laufwerke mit unterschiedlichen SCSI-ID`s gejumpert hast und daß die Boot-Platte die ID "0" hat. Gehe in das Controller-BIOS und sieh nach, ob dort der Eintrag unter "Boot SCSI ID" auch auf "0" steht! Andernfalls solltest Du mit "Use Default Settings" den Controller zurücksetzen. Unter "SCSI device configuration" sollte für beide Platten jeweils Sync 40 MB/s. eingetragen sein.
Zum Schluß: Setze bei beiden Festplatten einen Jumper bei "Force SE-Mode" und lasse den Teminator am Ende des Kabels dran; vielleicht haben die Fujitsu-Platten ja Probleme mit der automatischen Umschaltung von LVD auf SE-Mode.