Hi,
wenn du die Betriebssysteme auf verschiedenen Platten installierst, musst du nichts beachten. Musst dann halt nur im Bios immer die richtige Festplatte von der du gerade booten willst auswählen.
Aber sauberer als so, kann man zwei Betriebssysteminstallationen nicht voneinander trennen.
Wählst einfach im BIOS die 1. Festplatte als Bootplatte aus, machst dann Win2000 drauf (Nimm FAT32 als Dateisystem, wenn du von Win98 darauf zugreifen möchtest, NTFS kann WIn98 nämlich nicht / umgekehrt ist es aber kein problem), satartest dann neu, wenn alles installiert ist wählst im BIOS die 2. Festplatte als Bootplatte aus und installierst Windows 98.
Wäre vielleicht auch nicht falsch, während der Installation der Betriebssysteme die jeweils andere Festplatte, die nicht benutzt wird, abzuklemmen. Möglich, das es anders gar nicht geht.
mfg,
Stephan