Bombenleger Nachtrag zu: „LigandFit now being Scheduled.“
Habe gerade LigandFit NT_0.1.1 (2809) erhalten und bin recht ueberrascht. Der Agent ist weiterhin 3.0 (2809).
1. Der "energy grid completed" dauert gerade mal 3 m, wofuer der auch immer ist
2. der eigentliche Crunchprocess lautet dann "starting docking run"
3. Das "Current Protein Target" sieht aehnlich wie bei THINK aus, allerdings ohne Beschreibung
4. Die "Legend" ist so umfangreich das deren Inhalt wechselt
5. Die Grafik der "Current Prospective Ligand 3D Structure" dreht sich
6. Es gibt keine Derivate mehr, sondern "x of xx Ligands processed", wobei xx von UD vorgegeben wird
7. Nach einem Reboot und manuellem Restart wird 1. erneut gestartet und setzt dann nach ca. 7 m bei 6. fort
8. Nach Ende einer WU entsteht eine wahre Sendeorgie (bis zu 2 m bei DSL)
Geschwindigkeitsmaessig sieht es so aus:
- x of xx Ligands processed = 1 % im Agent gleich x of (xx / 100) ligands
- jeder ligand (x) kann bis zu 7, auch weniger, verschiedene 3D-Strukturen haben
- pro Agent-% sind bei 1470 MHZ zwischen 3 und 7 m einzuplanen (variabel)
- Eine aktuelle LigandFit-Statistik gibt es hier
Was gibt es sonst noch:
- Hits, wie bei THINK, gibt es nicht mehr, denn alle WUs sind Ex-THINK-Hit-WUs
- UD-Mon (1.7.5c) laeuft auch mit LigandFit (noch ohne Kennung), fuer alle die den nutzen
- an den ZA-Einstellungen muss nichts geaendert werden
- BlackIce ab 3.5 muessen die Advanced Application Protection neu erstellen (2 neue UD-Teile)
- nach jedem neuen receive muss mit BI 3.5 und App-Protection ein Modul mit "continue" bestaetigt werden (Ud_ligfit_Release.exe)
Fuer alle die noch THINK laufen haben, so sieht es im Grafikfenster aus:
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