Für NVidia Grafikkarten gebe ich dir meine Empfehlung. Für ATI gibt es auch Linuxtreiber, aber meiner Meinung nach werden die ATI Treiber nur halbherzig programmiert. Die ATI Treiber kommen auch relativ früh in den Leacy Zweig und werden dann nicht mehr weiterentwickelt.
NVidia bietet Treiber für Windows, Solaris, FreeBSD und GNU/Linux an.
Die Liste der unter Linux unterstützen Grafikkarten kannst du auf der Homepage von NVidia anschauen.
http://www.nvidia.de/Download/index.aspx?lang=de
Ich nutze Debian und installiere den NVidia Treiber so wie es im Ubuntu Wiki sehr ausführlich erklärt wird:
http://wiki.ubuntuusers.de/Grafikkarten/Nvidia/Manuelle_Treiberinstallation?highlight=NVidia
Wenn man einen aktuellen Linuxtreiber von NVidia installiert, dann werden alle halbwegs aktuellen Nvidia-Grafikkarten unter Linux unterstützt. Der NVidia-Treiber kommt auch nicht ganz so schnell in den Legacy Zweig wie bei ATI.
PS: Wenn du ein neues Mainboard kaufen willst, dann kannst du ja mal über ein Intel Board nachdenken und für deine Bildbearbeitung die tolle Onboard-Intel-Grafikkarte nutzen.
Zum Beispiel sollte dieses Gigabyte Board unter einer aktuellen Linuxdistribution gut laufen:
http://www.gigabyte.de/products/product-page.aspx?pid=3853