Habe seit Kurzem auch ein neues System auf S939-Basis. Ich habe ein MB mit K8T800 Pro Chipsatz, und bin sehr zufrieden damit. Aber um mal mit der Masse zu schwimmen empfehle ich dir nForce 3.
Wenn es PCIe für S939 schon geben würde, würde ich dir auf jeden Fall PCIe empfehlen, da es für AGP in absehbarer Zeit schon keine High-End-Grakas mehr geben wird (um hier auch mal mit der Masse schwarz zu sehen). Leider ist das für das letzte Quartal 2004 angekündigte PCIe für AMD-Boards noch nicht verfügbar, deshalb bleibt dir nichts übrig als entweder noch 1-2 Monate zu warten, oder auf AGP zu setzen. Sofern du also nicht vorhast, dir jedes Jahr die allerneueste und allerschnellste Grafikkarte zu kaufen, kannst du auch auf AGP setzen.
S939 ist der erste Sockel von AMD (evt. auch 940?), der auch DualChannel unterstützt, weshalb man das nutzen sollte. Von demher würde ich dir 2x512MB DualChannel DDR400 CL2 oder CL2,5 empfehlen (nur Marken-RAM!).