Hast du eventuell den Automounter installiert ? Damit kenne ich mich leider nicht aus, ich verwende ihn auch nicht.
Disketten werden normalerweise immer in das Verzeichissystem aufmontiert (gemounted, das ist germisch :-). Wenn man die Diskette aus dem Laufwerk nehmen will muß man vorher die Diskette unmounten. Das kann man mit dem Befehl:
"umount media/floppy" machen. Erst wenn du diesen befehl eingibt werden die Daten auf die Diskette geschrieben !
Wahrscheinlich hast du die disktte einfach so aus dem laufwerk genommen. Dabei wurden die daten nicht richtig auf die Diskette geschrieben. Mit einem CD-ROM Laufwerk kann dir das nicht passieren , weil das Laufwerk blockiert wenn die CD noch gemounted ist.
Diskette in das Verzeichnis /media/floppy einhängen (Voraussetzung /etc/fstab stimmt !):
mount /media/floppy oder "mount -t fat /dev/fd0 /media/floppy
Diskette aus dem verzeichnis /media/floppy aushängen:
umount /media/floppy
Von dem Automounter-Programm würde ich abraten, weil dir das dann auch mit einem CD-Laufwerk beim Einspielen von Software passieren kann.