Also ich würde als Erstes mal nachsehen, ob der Ordner wo die Temps gespeichert sind auch genau so in Emule eingetragen ist.
Bei Emule zu finden unter "Einstellungen/Verzeichnisse..."
Dort ist der Pfad angegeben und gucke dann nach, ob der kopierte Temp-Ordner auch dort ist. Wenn net, dann weis ihm den korrekten Pfad zu oder verschiebe den Ordner dahin.
Ansonsten isses egal welche Version du nimmst, außer bei so ganz alten Versionen, da bin ich mir net so sicher. Aber auch von edonkey zu emule ist das kompatibel.
Wenn das net klappt wüsste ich auch net mehr weiter!
PS: Ich habs auch selbst schon mal gemacht und bei mir gings!