So etwas ähnliches hatte ich auch schon mal geplant. Ich würde allerdings ein Raid System empfehlen.
Die Towers nebeneinander stellen, in beiden ein Netzteil und der eine Tower beinhaltet dann nur die Festplatten und werden durch das Netzteil in diesem Gehäuse gespeist. Die hängen dann am Raid Controller. Das andere Geräuse beinhaltet dann den "Rest" des Computers.
Ich würde die beiden Towers dann noch miteinander verschweißen, vielleicht mit Schnarnieren damit man sie auseinanderklappen kann. Und da in dem anderen Gehäuse dann massig Platz ist kann man da eine ziemlich dicke Wasserkühlung einbauen. Und schon ist die Riesenkiste auch noch leise.