Es ist richtig, dass Geräte sich heutzutage relativ problemlos IRQ'S teilen. In der Praxis sollte man dennoch dafür sorgen, dass die Grafikkarte allein steht. Deine Firewire - Karte steckt offenbar in dem PCI- Slot, der sich den Interrupt mit dem Agp- Slot teilt. Dieser sollte nach Möglichkeit nicht bestückt werden. Ziehe einfach die Betriebsanleitung deines Motherboards zu rate und finde dort heraus, welcher PCI- Slot am besten mit deiner Karte bestückt werden sollte.
Ob das der Grund für dein Problem ist, weiß ich allerdings nicht. Das Ruckeln könnte tausend verschiedene Gründe haben. Das fängt bei der Jumperung der IDE Geräte an und hört beim berühmten Southbridge- Bug bestimmter, älterer VIA- Chipsätze ( KT133 KT133 A, der erste KT266 etc ) auf. Ist denn der DMA- Modus deiner Festplatte aktiviert ?