Problem ist gelöst, jedenfalls scheint das so....
Ich habe alles ausgebaut und dann Stück für Stück wieder zusammengesetzt und jetzt scheint die Kiste stabil zu laufe. Ich habe allerdings statt der alten Realtek RTL8129 10MBit-Netzwerkkarte eine RTL8139 100MBit drin. Die besetzt zwar auch den selben IRQ wie die Grafikkarte (vorher kam einmal noch ein Bluescreen mit ner IRQ-Fehlermeldung), aber da scheint es zu funktionieren.
Leider kommt von der 100MBit-Karte das nächste Problem..... Win98 will die Treiber nicht annehmen, aber das ist eine andere Geschichte ;-)