Beim Backup wird alles gesichert.
Die Daten - ja, der Bootsektor nicht unbedingt, das kommt auf das Backup-Programm an. Zwischen Klonen einer Festplatte, Sicherung einer einzelnen Partition und und bloßer Datensicherung gibt es Unterschiede, und beim "Zurückspielen" von einer Platte mit MBR auf eine mit GPT-Bootsektor sind zwar eventuell die Daten da, aber starten lässt sie sich trotzdem nicht - manchmal selbst dann nicht, wenn man den Bootsektor nachträglich ändert, weil dann nämlich die Partitionierung u. U. nicht mehr stimmt.
Acronis kenne ich nicht, und bis jetzt bin ich mit den Windows-bordeigenen Sicherungs- und Wiederherstellungsmöglichkeiten sowie mit der EaseUS- und Minitool-freeware immer gut zurecht gekommen. Und überhaupt: wenn ich Deine Beiträge hier so lese, dann komme ich zu dem Ergebnis, dass Du ungefähr so viel Ahnung hast wie ich - nämlich wenig. Du hast doch einen neuen PC mit vorinstalliertem Win10 gekauft, richtig? Was backupst Du denn da dauernd, und was spielst Du hin und her? Bei Win10 kann doch selbst ein Amateur wie ich nicht viel falsch machen, wenn man erst liest und dann klickt. Und bevor ich in die Niederungen des BIOS, der Systemsicherung oder der Systemreparatur abtauche, frage ich erst mal jemanden, der mehr Ahnung hat als ich, bevor ich da irgendwas anklicke, ändere, lösche oder Programme benutze, die ich nicht beherrsche.