Möglicherweise falsch terminiert? - könnte erklären warum die Festplatte nicht immer aufscheint. Bus muss und darf nur an den 2 Enden terminiert werden (vielleicht hast du auch noch interne SCSI-Geräte?)! Wenn du 3 Enden hast dann ist das ein Problem.
Beispiel (T = Terminator):
entweder
T extern --------- Adapter --------- intern T
oder
T extern --------- Adapter T
oder
T Adapter -------- intern T
Normalerweise kannst du im BIOS des Adapters die Terminierung auf AUTO stellen, das funktioniert bei mir zumindest immer.
Die übrigen SCSI-Geräte wirst du wahrscheinlich selbst händisch terminieren müssen (Jumper -> Handbuch oder Informationen auf Internet-Site des Herstellers).
Übrigens musst du den Computer nicht immer neu starten, wenn du zum Beispiel die externe Festplatte erst später einschaltest (funktioniert denke ich mit allen Adaptec Controller): einfach unter Systemsteuerung -> System -> Gerätemanager auf "Aktualisieren" klicken, dann sollten alle Geräte erkannt werden (im Notfall 2x durchführen - mein System läuft damit stabil - Adaptec 2940AU).
Wenn das nichts bewirkt kann ich dir leider auch nicht weiterhelfen
sorry :-(