Vorrausgesetzt es sind alle benötigten Treiber vorhanden, dann kannst du ja Linux installieren. Bei Debian wird momentan ein 486er Prozessor noch unterstützt. Notfalls muß man auf einem anderen Linuxrechner einen Kern speziell für einen 486er Prozessor kompilieren. Das ist nicht schwer, alles ist menügeführt.
Der Kompilier gcc kann den Betriebsystemkern für verschiedene Prozessoren optimieren, sodas auch der jeweilige erweiterte Befehlsatz des Prozessors genutzt wird. Sowas kann man unter Windows (aus verständlichen Gründen )nicht machen.